پدر بزرگوارشان حضرت امام حسن عسكرى علیه السلام است. روايات بسيارى وجود دارد مبنى بر اين كه وى از نسل پيامبر صلی الله علیه و آله و سلم و از دودمان على و زهرا علیه السلام است وارد شده است.
نسب حضرت از طرف مادر:
مادر بزرگوارشان مليكه روميه، نرجس خاتون است كه سوسن و"صيقل"و"ريحانه" نيز ناميده مى شد. نرجس خاتون از طرف پدر، دختر يشوعا، پسر قيصر روم شرقى و از طرف مادر، نسل شمعون از ياران حضرت عيسى مسيح علیه السلام و وصىَ او به شمار مى رفته است .
پس امام دوازدهم شيعيان، حضرت محمد بن حسن بن على بن محمد بن على بن موسى بن جعفر بن محمد بن على بن حسين بن على بن ابى طالب علیه السلام است كه حسينى الاَب و حَسَنى الأم مى باشد. از طرف فاطمه دختر امام حسن علیه السلام يعنى مادر امام باقر علیه السلام. [1]